Safnið var stofnað af Kašpar Maria Šternberg og František Palacký árið 1818 til að varðveita tékkneska arfleifð og sjálfsmynd. Í upphafi lagði safnið áherslu á náttúrufræði með hjálp aðalsmannagjafa. Frá 1885 til 1891 var nýendurreisnarsögubyggingin á Wenceslas-torgi reist og er nú talin tákn um stolt Tékklands.
Í heimsstyrjöldunum tveimur varð safnið og söfn þess í ►